Gene Synthesis-盟基生物科技股份有限公司

客製化抗體-盟基生物科技股份有限公司

Gene Synthesis

Gene Synthesis

Gene Service

Gene Synthesis

全基因合成服務,提供密碼子優化和指定克隆載體

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一、服務介紹

盟基作為率先將全基因化學合成之客製化服務引進台灣市場的先行者,一直以來秉持為客戶提供快速、經濟且高品質的服務,讓客戶可在最短時間獲得實驗的起始材料進行後續研究。與傳統的分子克隆技術相比,全基因化學合成服務既節省了時間和金錢,又提供了無與倫比的自上而下的全客製化。



二、服務特色

1. 免費密碼子優化 (Codon Optimization)
基因的密碼子在不同物種間有密碼子使用偏移 (codon usage bias) 的現象,導致實驗中以原核生物系統表達真核生物蛋白質時,表達量時常不符預期。另外,有些基因序列的重複性太高,或片段中GC比例太高,導致蛋白轉錄效率低落。以上現象可透過密碼子優化,調整基因的DNA序列 (胺基酸序列相同),讓基因在不同系統維持高度表達效率。

密碼子優化是針對特定生物體使用首選密碼子的方法。目的是避免生物體內使用率低的稀有密碼子、調整GC含量、減少基因轉錄後mRNA的二級結構,去除不利於高效表達的序列,可有效地優化複雜序列,以顯著提高蛋白質表達水平。密碼子優化服務是對標準基因合成服務的補充。密碼子優化通常綜效評估以下多重因素:

✓ Cryptic splice sites
✓ Poly(N)
✓ Repeats
✓ RNA secondary structures
✓ Killer sequences
✓ Internal RBS sites
✓ GC content



2. 可指定任何載體
全基因合成服務可指定建構於任何載體,著實省下自行克隆的時間。
1. 預設克隆載體: pUC57。
2. 常見表達載體: 提供超過150種常見表達載體供您選擇。(分頁列表)
3. 客戶自行提供載體: 由客戶提供載體 (至少5ug質體)。
   


3. 可指定克隆使用的限制酶切位
依據您的實驗需求 (如其他克隆實驗),可以指定限制酶切位,並在合成基因同時合成兩端限制酶切位序列 ; 指定載體時建議一併指定限制酶切位(序列)確保基因序列in-frame,可正常表達重組蛋白。
* 若不指定載體及限制酶切位,一律使用 EcoRV平端接入pUC57載體。
此外,更可以同源重組方式將基因無痕接入載體的任何位置,而不需遷就限制酶切位進行克隆,此舉更能發揮完全客製化分子克隆的精隨。



4. 保證合成之基因序列100%正確
基因序列合成由Oligo合成開始至片段組合成完整基因,全程以一站式平台進行,後續經Sanger’s sequencing定序確保所合成之基因序列,每一個鹼基都與客戶需求相同,以達100%序列正確性。另外,再以限制酶切電泳驗證基因是否精準克隆至載體正確位置。雙重QC保證交付的質體所含基因序列100%正確。

 

三、服務預估工作天數

1. 免費密碼子優化
Gene Length Estimated Turnaround Time (business days)
<500 bp 5-7
501-1,000 bp 7-10
1001-1,500 bp 7-10
1,501-3,000 bp 10-15
3,001-4,500 bp 15-20
4,501-6,000 bp 20-25
>6,000 bp Quote
* 實際交貨期依序列評估後為準

 
 

四、客戶提供資訊

1. 基因合成序列 (選擇是否需要優化以及需優化物種) 
2. 指定亞克隆載體及其限制酶切位



 

五、到貨規格

1.  4 µg 凍乾質體 DNA
2.  定序報告 (電子檔)
3.  COA文件 (含限制酶切電泳確認圖和質體建構圖(電子檔))




關鍵字:Codon Optimization、gene synthesis

 
Express Cloning Vectors
Mammalian Yeast Baculovirus/Insect Bacterial Lentivirus Promoter test
pcDNA3.1(+) pcDNA3.1/Hygro(+) pAO815 pBacPAK8 pBluescript II KS(-) pET-22b(+) pET-32b(+) pGEX-6P-3 pLVX-IRES-Hyg pGL3-basic
pcDNA3.1(-) pcDNA3.1/Hygro(-) pPIC 3.5k pBacPAK9 pBluescript II KS(+) pET-23a(+) pET-41a(+) pMAL-c4x pLVX-rGFAP-EGFP-F2A-CMS pGL3-promoter
pcDNA3.1(+)_myc-His A pcDNA3.1/Zeo (+) pPIC9 pAcG2T pBluescript II SK(-) pET-24a(+) pET-41b(+) pMAL-c5E pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP pGL4.10
pcDNA3.1(+)_myc-His B pcDNA3.1/Zeo (-) pPIC9K pAcHLT A pBluescript II SK(+) pET-24a(+)-TEV pET-41c(+) pMAL-c5x pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro pGL4.26
pcDNA3.1(+)_myc-His C pCMV-3Tag-1a pPICZA pAcHLT B pET-3a pET-24b(+) pET-42a(+) pMAL-p5E    
pcDNA3.1(-)_myc-His A pCMV-3Tag-2a pPICZB pAcHLT C pET-3b pET-24c(+) pET-42b(+) pMAL-p5G    
pcDNA3.1(-)_myc-His B pCMV-3Tag-3a pPICZC pAcGHLT A pET-3c pET-24d(+) pET-42c(+) pMAL-p5X    
pcDNA3.1(-)_myc-His C pCMV-3Tag-4a pPICZalphaA pAcGHLT B pET-3d pET-25b(+) pET-43.1a(+) pQE-1    
pCI-Neo pcDNA3.1+C-eGFP pPICZalphaB pAcGHLT C pET-9a pET-26b(+) pET-43.1b(+) pQE-60    
pcDNA3.1+C-DYK pcDNA3.1+N-eGFP pPICZalphaC pAcSG2 pET-11a pET-27b(+) pET-45b(+) pGS-21a    
pcDNA3.1+C-HA pcDNA3.1+P2A-eGFP pESC-TRP pBAC-1 pET-11b pET-28a(+) pET-50b(+) pETDuet-1    
pcDNA3.1+C-6His pcDNA3.1+P2A pESC-URA pFastBac1 pET-11c pET-28a(+)-TEV pET-51b(+) pCDFDuet-1    
pcDNA3.1+C-Myc pcDNA3.1+N-DYK-P2A pESC-HIS pFastBacHT-A pET-11d pET-28b(+) pET-52b(+) pRSFDuet-1    
pcDNA3.1+N-DYK pcDNA3.1+C-DYK-P2A pESC-LEU pFastBacHT-B pET-14b pET-28c(+) pGEX-2TK pCOLADuet-1    
pcDNA3.1+N-HA pCMV-3Tag-1a-P2A   pFastBacHT-C pET-15b pET-29a(+) pGEX-4T-1 pGEX-4T-1-H(RBS)    
pcDNA3.1+N-6His pCMV-3Tag-3a-P2A   pFastBac-Dual pET-16b pET-29b(+) pGEX-4T-2 pGEX-4T-1-M(RBS)    
pcDNA3.1+N-Myc pcDNA3.4     pET-17b pET-29c(+) pGEX-4T-3 pGEX-5X-1-H(RBS)    
pcDNA3.1+N-GST(Thrombin) pGenLenti     pET-19b pET-30a(+) pGEX-5X-1 pGEX-5X-1-M(RBS)    
pcDNA3.1+N-GST(TEV) pmirGLO Dual-Luciferase     pET-20b(+) pET-30b(+) pGEX-5X-2 pGEX-6P-1-H(RBS)    
  psiCheck-2     pET-21a(+) pET-30c(+) pGEX-5X-3 pGEX-6P-1-M(RBS)    
        pET-21b(+) pET-31b(+) pGEX-6P-1 pMAL-c4x-1-H(RBS)    
        pET-21d(+) pET-32a(+) pGEX-6P-2 pMAL-c4x-1-M(RBS)    
              pGenDONR